Hệ thống câu lạc bộ được thiết kế dựa trên Thuyết đa trí tuệ (các loại hình thông minh), cơ chế hoạt động của Não bộ và Tâm lý học lứa tuổi nhằm giúp học sinh phát huy năng khiếu và theo đuổi những sở thích của riêng mình. CLB là nơi sinh hoạt của tất cả học sinh Trường Tiểu học - THCS Fansipan có cùng chung niềm đam mê dưới sự điều phối của các thầy cô giáo. Các CLB trải rộng trên nhiều lĩnh vực, từ Khoa học – Công nghệ, Kỹ năng, Thể thao, Nghệ thuật,…
